Museum unik ini didedikasikan untuk sejarah roti selama 6.000 tahun sebagai dasar yang tak terpisahkan dari budaya dan peradaban manusia. Museum ini didirikan dan berkembang berkat komitmen pribadi selama puluhan tahun dari Willy Eiselen (1896-1981) dan putranya, Hermann Eiselen (lahir 1926). Keduanya berurusan dengan pembuatan dan penjualan bahan-bahan roti dan termasuk di antara para pemasok terkemuka untuk perdagangan roti.
Kedua pengusaha ini mendirikan museum sebagai Museum Roti Jerman pada tahun 1955 sebagai sebuah asosiasi. Pameran permanen pertama dimulai pada tahun 1960. Museum ini adalah yang pertama dan selama bertahun-tahun satu-satunya museum sejenis di dunia. Museum ini merupakan institusi swasta yang didanai oleh para pendirinya. Pada tahun 1991, pendanaan museum diambil alih oleh Eiselen Foundation, sebuah lembaga amal independen; pada saat yang sama museum pindah ke Salzstadel, sebuah gudang bersejarah di pusat Ulm.
Di sini museum berkembang, dan pada tahun 2004 menyambut pengunjung yang ke satu juta.
