Museum ini didirikan pada tahun 1930-an di Istana Uskup, yang diinginkan oleh Corrado Ricci pada awal abad ke-20 dan didirikan berkat Canon Katedral Maurizio Cavallini. Terpaksa ditutup karena beberapa kerusakan yang diderita selama Perang Dunia II, dibuka kembali dan ditutup lagi dalam fase bergantian sampai akhir abad ini dalam menghadapi intervensi struktural yang terus menerus dan berlangsung lama. Jadi, museum ini dibuka kembali pada tahun 1950-an, ditutup pada tahun 1980-an, dibuka kembali pada tahun 1990-an, sampai keputusan yang tidak terlalu berat dibuat untuk memindahkan museum ke Gereja Sant'Agostino yang indah.
Museum ini telah dihidupkan kembali setelah proyek tata letak oleh Guicciardini & Magni Architetti; Pameran ini menyajikan karya-karya dari Katedral dan, sebagian kecil, dari gereja-gereja di Keuskupan; tetapi manfaat terbesarnya adalah bahwa pameran ini melestarikan, selain beberapa lukisan, patung kayu dan tanah liat, jubah suci, satu-satunya patung marmer yang masih ada dari monumen besar abad ke-14 yang didirikan di Katedral.
Di bawah loggia presbytery terdapat beberapa kolom dari abad ke-11. Di sepanjang tangga terdapat ambang pintu gereja S. Lorenzo a Montalbano yang berasal dari abad ke-10. Dekorasi marmer dengan representasi kerub adalah karya Mino da Fiesole. Sebelas lengkungan trefoil dan dua kolom marmer, kemungkinan milik paduan suara kuno Biara S. Giusto, menampilkan potret kepala biara dan malaikat dengan prasasti Gotik dan Latin dari abad ke-14.
Yang dipamerkan di museum adalah karya-karya dari: Domenico di Michelino, Rosso Fiorentino, Baldassarre Franceschini, Daniele Ricciarelli, Stefano di Antonio Vanni, Antonio del Pollaiolo, Giambologna dan lain-lain.