Otvorio 2001 Kardinal Karlo Maria Martini, za koga je onda po imenu 2017 godine, muzej je svrha dolazak važan projekat koji neki od najboljih figure Milanska Archbishops u dvadesetom veku su dali svoje odlučna doprinos. Korijene datiraju prvi intuicija Blagoslovene Ildefonso Schuster 1931, onda zauzimaju Kardinal Montini u 1960 to ukazuje kao sjedište new muzej hodnici u Sant'eustorgio, jedan od ključna mjesta za povijest Ambrosian Kršćanstva. Konačno, Kardinale Martini, u Osamdesetima je bio povjeren sa težak zadatak početi rekonstrukciju rad Cloisters, teško oštećeni od napada Drugog Svjetskog Rata, povjerena Belgiojoso studio.Prvi Dominikanskoj Manastiru u Milanu je bila smještena ovdje, počev od trinaesti stoljeće, i dva Cloisters, gdje Muzeju Bazilika Sant'eustorgio i Biskupijski su Muzej lociran, su ono što je ostalo od ta drevna manastir.
Stalna kolekcija Muzeja biskupije, u kom se nalazi drugi manastir, sastoji se od više od hiljadu radova između dva i XXI stoljeća. Iz Nadbiskupa je uredu je došao iz kolekcije od Milanska archbishops (deo Monti, Visconti, Riccardi, Pozzobonelli kolekciju, i potpuno Erba Odescalchi kolekciju).
Pored slika iz crkava biskupije, u muzeju se čuva značajna grupa radova na liturškom namještaju. Kolekciju je završen do deo posvećen zlato sredstva (radi o Četrnaesti i petnaesti stoljeća, uglavnom Toskanskog, prikupljeni od strane Prof. Alberto Crespi i donirao u muzej), kao skulpture i slike iz kolekcije od Katarina Marcenaro, crtežima iz Sozzani kolekciju i dragocjeni Schubert ostavština.
Konačno, da prvi srž kiparska radi do Lucio Fontana, dodate su brojne radi XX i XXI stoljeća, deklaraciju o raste interesu muzeju za contemporaneity.
