Muzej je izgrađen između 1933. i 1939. kako bi u njega smjestila dva gigantska broda cara Kaligule (37-41. n.e.) izvučena iz voda jezera između 1929. i 1931. godine. Stoga je to bio prvi muzej u Italiji koji je izgrađen u funkciji sadržaja, dva trupa, odnosno m. 71,30 x 20 i m. 73 x 24, nažalost uništen u požaru 1944. godine. Ponovo otvoren 1953. godine, Muzej je ponovo zatvoren 1962. godine i konačno ponovo otvoren 1988. godine.U novom tlocrtu lijevo je krilo posvećeno brodovima, od kojih su neki materijali izloženi, kao što je rekonstrukcija krova bronzanim crijepom, dva sidra, pokrivanje pramčanog točka, nešto originalno ili rekonstruirano na brodu. oprema (a , klipna pumpa, blok, platforma sa kugličnim ležajem). Vidljive su i dvije makete brodova u mjerilu 1:5 i potpuna rekonstrukcija aposticio krme prvog broda, na kojoj su postavljene bronzane kopije kutija sa divljim protomima.Desno krilo je umesto toga posvećeno stanovništvu albanske teritorije u doba republikanaca i carstva, sa posebnim osvrtom na bogomolje; Izloženi su zavjetni materijali iz Velletrija (S. Clemente), iz Campoverdea (Latina) iz Genzana (Pantanaccijev stipe) i iz Dijaninog svetišta u Nemiju, pored građe iz zbirke Ruspoli. Unutar ovog krila također je moguće diviti se muzejskom dijelu rimskog popločavanja clivusa Virbii, koji je vodio od Ariccia do Dijaninog svetišta.
