Muzej San Gimignana nalazi se u drevnom samostanu Santa Chiara, koji je u prošlosti služio kao zimski vrt za mlade dame iz dobrih porodica, a kasnije i kao srednja škola. Kompleks je podvrgnut restauratorskim radovima između 1980-ih i 1990-ih, transformirajući ga u izložbeni centar od velikog interesa. Unutar muzeja postoji nekoliko odjeljaka, uključujući Arheološki muzej, Santa Fina Spezieria i Galeriju moderne i savremene umjetnosti "Raffaele De Grada".Arheološki muzej San Gimignana čuva važna svedočanstva koja govore o najstarijoj istoriji San Gimignana, od arhaičnog etrurskog doba do osamnaestog veka. Izložba je podijeljena u dvije cjeline: jedan posvećen etrurskoj i rimskoj umjetnosti, sa nalazima iz naselja i nekropola na tom području, koji datiraju iz 7.-1. stoljeća prije nove ere; drugi dio je posvećen zanatskim proizvodnim djelatnostima, poput stakla i keramike, koje su bile prisutne u gradu tokom srednjeg vijeka.Spezieria di Santa Fina pripojena je istoimenoj bolnici, osnovanoj sredinom 13. vijeka. Izložba predstavlja namještaj i opremu iz drevnih zdravstvenih ustanova grada. Raspored rekreira ambijent i originalne arome apoteke, jedne od najstarijih u Toskani. Proizvodi su se nalazili u visokokvalitetnim keramičkim i staklenim posudama od 15. do 18. stoljeća. Izložbeni itinerer prati istoriju lekova i aktivnosti vezane za rad apoteke. Izloženi su i brojni drevni lijekovi, poput ulja škorpiona i komponenti koje se koriste u pripremi lijekova.Galerija moderne i savremene umetnosti "Raffaele De Grada" je dobila ime po poznatom milanskom slikaru Raffaeleu De Grada. Umjetnik je odabrao San Gimignano kao svoj dom nakon putovanja po cijeloj Evropi. U galeriji su izloženi brojni radovi De Grada i drugih umjetnika iz 19. i 20. stoljeća. Stalna zbirka obuhvata dela iz toskanskog 19. i 20. veka. Tu su i dvije monografske sobe posvećene Niccolò Cannicci i Raffaele De Grada, kao i radovi Giannetta Fieschija. Galeriju obogaćuju i italijanske slike od 1930-ih do 1980-ih iz zbirke Pacchiani.Galerija moderne i savremene umjetnosti predstavlja najvažniji izložbeni prostor u San Gimignanu, gdje se često organiziraju privremene izložbe posvećene 19., 20. i savremenoj umjetnosti.