Muzej San Gimignano se nahaja v starodavnem samostanu Santa Chiara, ki je bil v preteklosti uporabljen kot zimski vrt za mlade dame dobrih družin in kasneje kot srednja šola. Kompleks je bil med osemdesetimi in devetdesetimi leti prenovljen in preoblikovan v razstavišče velikega zanimanja. Znotraj muzeja je več oddelkov, vključno z Arheološkim muzejem, Santa Fina Spezieria in galerijo moderne in sodobne umetnosti "Raffaele De Grada".Arheološki muzej San Gimignana hrani pomembna pričevanja, ki govorijo o najstarejši zgodovini San Gimignana, od arhaične etruščanske dobe do osemnajstega stoletja. Razstava je razdeljena na dva sklopa: eden je posvečen etruščanski in rimski umetnosti z najdbami iz naselbin in nekropol na tem območju, ki segajo v 7.–1. stoletje pr. drugi del pa je posvečen obrtniškim proizvodnim dejavnostim, kot sta steklo in keramika, ki sta bili v mestu prisotni v srednjem veku.Spezieria di Santa Fina je pripojena k istoimenski bolnišnici, ustanovljeni sredi 13. stoletja. Razstava predstavlja pohištvo in opremo iz starodavnih zdravstvenih ustanov mesta. Postavitev poustvari okolje in izvirne arome lekarne, ene najstarejših v Toskani. Izdelki so bili shranjeni v visokokakovostnih keramičnih in steklenih posodah iz 15. do 18. stoletja. Itinerar razstave sledi zgodovini medicine in dejavnosti, povezanih z delom lekarne. Razstavljena so tudi številna starodavna zdravila, kot so škorpijonovo olje in sestavine, ki se uporabljajo za pripravo zdravil.Galerija moderne in sodobne umetnosti "Raffaele De Grada" je poimenovana po znanem milanskem slikarju Raffaeleju De Grada. Umetnik si je po potovanju po Evropi izbral San Gimignano za svoj dom. V galeriji so razstavljena številna dela De Grada in drugih umetnikov 19. in 20. stoletja. Stalna zbirka vključuje dela iz toskanskega 19. in 20. stoletja. Tu sta tudi dve monografski sobi, posvečeni Niccolu Cannicciju in Raffaeleju De Grada ter delom Giannetta Fieschija. Galerijo bogatijo tudi italijanske slike od 30. do 80. let prejšnjega stoletja iz zbirke Pacchiani.Galerija moderne in sodobne umetnosti predstavlja najpomembnejši razstavni prostor v San Gimignanu, kjer se organizirajo pogoste občasne razstave, posvečene umetnosti 19., 20. in sodobni umetnosti.
