Muzej okupacije otvoren je 1.srpnja 2003. i posvećen je razdoblju od 1940. do 1991. godine u povijesti Estonije, kada je zemlja okupirala Sovjetski Savez, a zatim nacistička Njemačka, a zatim opet Sovjetski Savez. Većinu tog vremena zemlja je poznata kao Estonska Sovjetska Socijalistička Republika.