Muzeu u krijua në vitet tridhjetë të shekullit të kaluar në Pallatin e Peshkopit, i dëshiruar nga Corrado Ricci në fillim të shekullit të njëzetë dhe i krijuar falë Kanonit të Katedrales Maurizio Cavallini. E detyruar të mbyllet për shkak të disa dëmeve të pësuar gjatë Luftës së Dytë Botërore, ajo u rihap dhe u mbyll e fik deri në fund të shekullit përballë ndërhyrjeve strukturore të vazhdueshme dhe të gjata. Kështu u rihap në vitet 1950, u mbyll në vitet 1980, u rihap në vitet 1990, deri në vendimin më pak të vështirë për ta zhvendosur muzeun në Kishën e bukur të Sant'Agostinos.Muzeu kthehet në jetë pas projektit të paraqitjes nga Guicciardini & Magni Architetti;Ekspozita prezanton punime nga Katedralja dhe, në një masë të vogël, nga kishat e Dioqezës; por vlera e saj më e madhe është ajo e ruajtjes, përveç disa pikturave, skulpturave në dru dhe balte, veshje të shenjta, të vetmet skulptura të mbijetuara prej mermeri të monumenteve të mëdha të shekullit të katërmbëdhjetë të ngritura në Katedrale.Nën lozhën e rektoratit janë rreshtuar disa kolona të shek. Përgjatë shkallëve ndodhet arkitra e kishës S. Lorenzo a Montalbano që daton në shekullin e 10. Frizi i mermerit me paraqitjet e kerubinëve është vepër e Mino da Fiesole. Njëmbëdhjetë harqe me tre fletë dhe dy kolona mermeri, ndoshta që i përkasin një kori të lashtë të Badia di S. Giusto, paraqesin portrete abatësh dhe engjëjsh me mbishkrime gotike dhe latine nga shekulli i 14-të.Në muze janë ekspozuar vepra nga: Domenico di Michelino, Rosso Fiorentino, Baldassarre Franceschini, Daniele Ricciarelli, Stefano di Antonio Vanni, Antonio del Pollaiolo, Giambologna dhe të tjerë.
