Muzeul Antonian, redeschis în 1995, oferă un traseu unic printre comorile artistice realizate, de-a lungul secolelor, pentru bazilică și pentru venerabila Arcă a Sfântului Anton: picturi, sculpturi, tencuieli, veșminte sacre, tapiserii, aurari, până astăzi puțin accesibile publicului. Sunt expuse autentice capodopere de artă: luneta cu fresce de Mantegna pentru portal de catedrală,insertii de lemn din secolul al Xv-lea, prețios Vas de artă de bijutier German Cinqucento, altar-piese de Tiepolo și Piazzetta, o rară veșmânt liturgic țesute în Lyon, în secolul al Xviii-lea.
