Muzeul Civic din Palazzo Te este situat în camerele de la etajul superior. Există patru colecții expuse:
Secțiunea Gonzaghesca Această secțiune cuprinde materiale referitoare în principal la istoria de mantua în vârstă gonzaga (1328-1707): o Colecție de Monede este format din 595 de monede produs de Menta de Mantua, o colecție de conuri și pumni, vechiul set de măsuri și greutăți de Stat de Mantua, și o colecție de 62 de medalii de familia Gonzaga, și de ilustre personaje mantovani.
Donație "Arnoldo Mondadori"; Această secțiune cuprinde nouăsprezece picturi de Federico Zandomeneghi (1841-1917), și de treisprezece ani, de către Armando Spadini (1883-1925), colectate de Arnoldo Mondadori și a donat în anul 1974 de către moștenitorii persoana de mantuan origine.
Colecția egipteană "Giuseppe Acerbi"; Giuseppe Acerbi (1773-1846), Consul General al Austriei în Egipt, a participat în 1829 la unele faze ale celebrei expediții arheologice conduse de Jean François Champollion. A constituit o importantă colecție de materiale arheologice, 500 de piese pe care în 1840 le-a donat orașului Mantua. Acum, colecția sa este expusă în întregime în Palazzo Te.
Mesopotamian de colectare "Ugo Sissa"; Colecția format de Ugo Sissa, arhitect și pictor Mantuan (1913-1980), arhitectul-șef de la Bagdad între 1953 și 1958, este format din aproximativ 250 de piese de arta Mesopotamiana datează între sfârșitul celui de-al șaselea mileniu Î. hr. și sfârșitul primului mileniu d. hr.
