ARQUA este o referință esențială pentru a descoperi patrimoniul subacvatic spaniol în două mari zone. Primul, "Patrimoniul cultural subacvatic", care se concentrează pe explicarea metodologiei utilizate în săpăturile subacvatice. Cele două clădiri pentru o structură modernă impresionantă, legată sub nivelul solului și concepută pentru a crea un efect subacvatic. În interior, acest spațiu remarcabil conține exponate care explică procesul fascinant al arheologiei subacvatice în sine, precum și o colecție eclectică de artefacte legate de navele istorice folosite în comerțul maritim antic al Mediteranei. O caracteristică interesantă este replica uneia dintre navele feniciene (secolul al VII-lea d.Hr.), descoperită în Mazarrón. Cealaltă zonă, cunoscută sub numele de "Mare Hibericum", invită vizitatorii să descopere Penisula Iberică prin intermediul istoriei comerciale dinamice a Mediteranei, din antichitate până în secolul al XIX-lea. Există, de asemenea, colți de elefant din epoca feniciană, descoperiți în situl Bajo de la Campana. Acesta este primul muzeu de arheologie subacvatică din Spania. Unele dintre cele mai bune caracteristici sunt secțiunile transversale reconstruite ale navelor, care arată cum erau construite și cum erau depozitate încărcăturile. Există câteva diorame în miniatură foarte detaliate care prezintă scene de activitate portuară și modele de nave din diferite epoci.
Ultima expoziție este despre fregata spaniolă Nuestra Senora de las Mercedes, care s-a scufundat în largul Portugaliei în 1804. Epava a dat naștere unui important proces juridic între guvernul spaniol și compania de vânătoare de comori Odyssy Marine Exploration, care a dus la returnarea către Spania a unor artefacte jefuite în valoare de aproximativ 500 de milioane de dolari, inclusiv o mulțime de monede tradiționale spaniole, care sunt expuse la muzeu.