Rozwój Bilbao i jego morska historia idą w parze, biorąc pod uwagę dwudziestowieczny rozwój miasta jako jednego z czołowych miast portowych Europy. Muzeum Morskie zagłębia się w tę historię, sięgając głębiej niż tylko w morską przeszłość Bilbao, aby również ujawnić tło portu, ludzi, którzy żyli wzdłuż ujścia rzeki i jak to wszystko wpłynęło na ewolucję miasta.Muzeum jest odpowiednio zlokalizowane wzdłuż suchych doków starej stoczni Euskalduna (zbudowanej w 1900 r. i zamkniętej w 1984 r.), przyjaznej dla dzieci przestrzeni, która zawiera zarówno wewnętrzne, jak i zewnętrzne wystawy. Wewnątrz można obejrzeć intrygujący film o historii Bilbao, obejrzeć modele statków i łodzi, a także modele naturalnej wielkości, w tym reprodukcję fantazyjnej drewnianej felukki konsulatu. Następnie, na zewnątrz, można zwiedzić suche doki, inne eksponaty i przejść się wzdłuż ujścia rzeki.
