Muzeum San Gimignano se nachází ve starobylém klášteře Santa Chiara, který v minulosti sloužil jako zimní zahrada pro mladé dámy z dobrých rodin a později jako střední škola. Areál prošel v 80. a 90. letech restaurátorskými pracemi a proměnil jej ve výstavní centrum velkého zájmu. Uvnitř muzea je několik sekcí, včetně Archeologického muzea, Santa Fina Spezieria a Galerie moderního a současného umění „Raffaele De Grada“.Archeologické muzeum San Gimignano obsahuje důležitá svědectví, která vyprávějí nejstarší historii San Gimignana, od archaické éry Etrusků až do osmnáctého století. Expozice je rozdělena do dvou částí: jedna je věnovaná etruskému a římskému umění s nálezy z osad a nekropolí v této oblasti, pocházejících ze 7.–1. století před naším letopočtem; druhá část je věnována řemeslným výrobním činnostem, jako je sklo a keramika, které se ve městě vyskytovaly ve středověku.Spezieria di Santa Fina je připojena ke stejnojmenné nemocnici založené v polovině 13. století. Expozice představuje nábytek a zařízení ze starobylých městských zdravotnických ústavů. Uspořádání obnovuje prostředí a původní vůně lékárny, jedné z nejstarších v Toskánsku. Výrobky byly obsaženy ve vysoce kvalitních keramických a skleněných nádobách pocházejících z 15. až 18. století. Itinerář výstavy sleduje historii lékařství a činnosti související s prací lékárníka. Vystavena je také řada starověkých léků, například olej ze štírů a složky používané při přípravě léků.Galerie moderního a současného umění „Raffaele De Grada“ je pojmenována po známém milánském malíři Raffaele De Grada. Umělec si vybral San Gimignano jako svůj domov poté, co cestoval po Evropě. Galerie vystavuje mnoho děl De Grady a dalších umělců 19. a 20. století. Stálá sbírka zahrnuje díla z toskánského 19. a 20. století. K dispozici jsou také dvě monografické místnosti věnované Niccolò Canniccimu a Raffaele De Grada a také dílům Giannetta Fieschiho. Galerii obohacují také italské malby z 30. až 80. let 20. století ze sbírky Pacchiani.Galerie moderního a současného umění představuje nejvýznamnější výstavní prostor v San Gimignanu, kde se pořádají časté dočasné výstavy věnované umění 19., 20. a současnému umění.