Múzeum San Gimignano sa nachádza v starobylom kláštore Santa Chiara, ktorý v minulosti slúžil ako konzervatórium pre mladé dámy z dobrých rodín a neskôr ako stredná škola. Areál prešiel v 80. a 90. rokoch reštaurátorskými prácami, ktoré ho premenili na výstavisko veľkého záujmu. Vnútri múzea je niekoľko sekcií vrátane Archeologického múzea, Santa Fina Spezieria a Galérie moderného a súčasného umenia „Raffaele De Grada“.Archeologické múzeum San Gimignano obsahuje dôležité svedectvá, ktoré rozprávajú o najstaršej histórii San Gimignana, od archaickej éry Etruskov až po 18. storočie. Expozícia je rozdelená do dvoch častí: jedna je venovaná etruskému a rímskemu umeniu s nálezmi z osád a nekropol v tejto oblasti zo 7. – 1. storočia pred Kristom; druhá časť je venovaná remeselnej výrobnej činnosti, ako je sklo a keramika, ktoré boli v meste prítomné v stredoveku.Spezieria di Santa Fina je pričlenená k nemocnici s rovnakým názvom, založenej v polovici 13. storočia. Expozícia predstavuje zariadenie a vybavenie zo starobylých zdravotníckych zariadení mesta. Usporiadanie pripomína prostredie a pôvodné vône lekárne, jednej z najstarších v Toskánsku. Výrobky boli obsiahnuté vo vysoko kvalitných keramických a sklenených nádobách z 15. až 18. storočia. Itinerár výstavy sleduje históriu medicíny a činnosti súvisiace s prácou lekárnika. Vystavených je aj množstvo starodávnych liekov, napríklad olej zo škorpiónov a zložky používané pri príprave liekov.Galéria moderného a súčasného umenia „Raffaele De Grada“ je pomenovaná po známom milánskom maliarovi Raffaelovi De Gradovi. Umelec si vybral San Gimignano ako svoj domov po tom, čo cestoval po Európe. V galérii sú vystavené mnohé diela De Gradu a iných umelcov 19. a 20. storočia. Stála zbierka zahŕňa diela z toskánskeho 19. a 20. storočia. Sú tu aj dve monografické miestnosti venované Niccolò Canniccimu a Raffaelovi De Gradovi, ako aj dielam Giannetta Fieschiho. Galériu obohacujú aj talianske maľby z 30. až 80. rokov 20. storočia zo zbierky Pacchiani.Galéria moderného a súčasného umenia predstavuje najvýznamnejší výstavný priestor v San Gimignane, kde sa organizujú časté dočasné výstavy venované umeniu 19., 20. a súčasného umenia.
