ARQUA ialah rujukan penting untuk menemui warisan bawah laut Sepanyol di dua kawasan yang hebat. Yang pertama, "Warisan Budaya Bawah Air", yang memberi tumpuan kepada penjelasan metodologi yang digunakan dalam penggalian bawah air.Kedua-dua bangunan untuk struktur moden yang mengagumkan, dihubungkan di bawah paras tanah dan direka bentuk untuk mencipta kesan bawah air. Di dalamnya, ruang luar biasa ini mengandungi pameran yang menerangkan proses menarik arkeologi bawah air itu sendiri, dan koleksi artifak eklektik yang berkaitan dengan kapal bersejarah yang digunakan dalam perdagangan maritim Mediterranean purba.Satu ciri menarik ialah replika salah satu kapal Phoenicia (abad ke-7 Masihi), yang ditemui di Mazarrón. Kawasan lain, yang dikenali sebagai "Mare Hibericum", menjemput pelawat untuk menemui Iberia Penisula melalui sejarah perdagangan dinamik Mediterranean, dari zaman dahulu hingga abad ke-19.Terdapat juga gading gajah dari zaman Phoenicia, ditemui di tapak Bajo de la Campana. Ia adalah muzium arkeologi bawah air pertama di Sepanyol.Beberapa ciri terbaik ialah keratan rentas kapal yang dibina semula yang menunjukkan cara kapal itu dibina dan cara kargo disimpan. Terdapat beberapa diorama mini yang sangat terperinci yang menunjukkan adegan aktiviti pelabuhan dan model kapal dari pelbagai era.Paparan terakhir ialah mengenai kapal frigat Sepanyol Nuestra Senora de las Mercedes, yang karam di perairan Portugal pada tahun 1804. Bangkai kapal itu menimbulkan kes perundangan yang penting antara kerajaan Sepanyol dan syarikat pemburu harta karun Odyssy Marine Exploration, yang mengakibatkan pulangan kira-kira $500 juta bernilai artifak yang dirompak ke Sepanyol, termasuk banyak syiling tradisional Sepanyol yang dipamerkan di muzium.