Muzium ini dibina antara 1933 dan 1939 untuk menempatkan dua kapal gergasi kepunyaan maharaja Caligula (37-41 AD) pulih dari perairan tasik antara 1929 dan 1931. Oleh itu, ia adalah muzium pertama di Itali yang dibina dalam fungsi daripada kandungan, dua badan kapal berukuran masing-masing m. 71.30 x 20 dan m. 73 x 24, malangnya musnah semasa kebakaran pada tahun 1944. Dibuka semula pada tahun 1953, Muzium ini ditutup semula pada tahun 1962 dan akhirnya dibuka semula secara muktamad pada tahun 1988.Dalam susun atur baru, sayap kiri didedikasikan untuk kapal, yang mana beberapa bahan dipamerkan, seperti pembinaan semula bumbung dengan jubin gangsa, dua sauh, penutup roda haluan, beberapa asli atau dibina semula di atas kapal. peralatan (a , pam omboh, blok, platform galas bebola). Turut kelihatan ialah dua model kapal pada skala 1:5 dan pembinaan semula skala penuh buritan kapal pertama, di mana salinan gangsa kotak dengan protom liar telah diletakkan.Sayap kanan sebaliknya didedikasikan kepada penduduk wilayah Albania pada zaman Republikan dan Imperial, dengan mengambil kira tempat ibadat; bahan nazar dari Velletri (S. Clemente), dari Campoverde (Latina) dari Genzano (stipe Pantanacci) dan dari Sanctuary of Diana di Nemi dipamerkan, sebagai tambahan kepada bahan dari Koleksi Ruspoli. Di dalam sayap ini juga mungkin untuk mengagumi bahagian muzium paving Rom clivus Virbii, yang menuju dari Ariccia ke Sanctuary of Diana.