ARQUA ir būtiska atsauce, lai iepazītu Spānijas zemūdens mantojumu divās lielās jomās. Pirmajā - "Zemūdens kultūras mantojums", kurā galvenā uzmanība pievērsta zemūdens izrakumos izmantotās metodikas skaidrojumiem. Divas ēkas iespaidīgai modernai struktūrai, kas ir savienotas zem zemes līmeņa un veidotas tā, lai radītu zemūdens efektu. Šīs ievērojamās telpas iekšpusē ir eksponāti, kas skaidro pašu aizraujošo zemūdens arheoloģijas procesu, kā arī eklektiska artefaktu kolekcija, kas saistīta ar vēsturiskajiem kuģiem, kurus izmantoja senajā Vidusjūras jūras tirdzniecībā. Interesants eksponāts ir viena no Mazarronā atrastā feniķiešu kuģa replika (7. gs. pēc Kristus dzimšanas). Otrā zona, kas pazīstama kā "Mare Hibericum", aicina apmeklētājus iepazīt Pireneju pussalu caur dinamisko Vidusjūras tirdzniecības vēsturi no antīkajiem laikiem līdz 19. gadsimtam. Bajo de la Campana vietā ir atrasti arī ziloņu ilkņi no feniķiešu laikiem. Tas ir pirmais zemūdens arheoloģijas muzejs Spānijā. Viens no labākajiem eksponātiem ir rekonstruēti kuģu šķērsgriezumi, kas parāda, kā kuģi tika būvēti un kā tajos tika uzglabātas kravas. Ir dažas ļoti detalizētas miniatūras diorāmas, kurās redzamas ostas darbības ainas un dažādu laikmetu kuģu modeļi.
Pēdējā ekspozīcija ir veltīta Spānijas fregatei Nuestra Senora de las Mercedes, kas nogrima pie Portugāles krastiem 1804. gadā. Šī kuģa nogrimšana izraisīja svarīgu tiesas prāvu starp Spānijas valdību un dārgumu meklēšanas uzņēmumu Odyssy Marine Exploration, kuras rezultātā Spānijai tika atdoti aptuveni 500 miljonus ASV dolāru vērti izlaupītie artefakti, tostarp bagātīgas tradicionālās Spānijas monētas, kas ir apskatāmas muzejā.