U kompleksu Citadele muzeja od 1992. godine nalazi se Pinacoteca Nazionale.Pinakoteka je jedno od izložbenih mjesta Nacionalnog arheološkog muzeja u Cagliariju.Zgrada u kojoj se nalazi, raspoređena na tri razine, čini se kao proizvod spoja između moderne intervencije i poštovanja prema drevnim strukturama iz šesnaestog stoljeća.Unutra se nalaze slike od ogromne umjetničke i povijesne važnosti.Pinakoteka ima zbirku slika usredotočenu na Sardiniju, u rasponu od 15. do 20. stoljeća.Temeljnu jezgru zbirke čine "retablos", velike oltarne pale s nekoliko odjeljaka oslikanih na drvu, katalonske i lokalne škole (15.-16. st.). (Samo da pojasnimo, Retablo je španjolski izraz koji označava veliku oltarnu palu arhitektonski uokvirenu. Retablo se može sastojati od panelne slike u odjeljcima koji, ovisno o dijelovima od kojih se sastoji, mogu biti diptih, triptih ili poliptih , ali može biti oblikovan i reljefnim pretincima, ili oslikanim pretincima koji se izmjenjuju s reljefnim pretincima.Pojam retablo u španjolskom ima latinsku etimologiju, od riječi re(tro)tabulum altaris - dorzalna ploča oltara.)Ova zbirka nastala je u drugoj polovici devetnaestog stoljeća, nakon gašenja crkvenih ustanova i preuzimanja njihove imovine od strane države.Baština je obogaćena dragocjenom zbirkom tkanina, vezova, tkanja i košara, kućnog i liturgijskog pokućstva, skulptura, keramike, oružja, kamenih elemenata, grbova, zlatarskih umjetnina i nakita.Ukupno ima oko 1300 komada. Među slikama brojni su primjerci iz radionice Cavara, Manaisa, Figuere, Matesa, Marcela, Castagnole itd...Zbirka tkanina, namještaja, oružja itd. umjesto toga izložena je naizmjenično zbog nedostatka prostora i uključuje artefakte u rasponu od srednjeg vijeka do 19. stoljeća.
