Národné archeologické múzeum v Eboli a Údolie stredného Sele, otvorené pre verejnosť od marca 2000, sa nachádza v bývalom kláštore San Francesco, monumentálnom komplexe, ktorý siaha až do trinásteho storočia a bol počas šestnásteho storočia značne prestavaný.
Usporiadanie, ktoré ešte nie je dokončené vo všetkých sekciách, je usporiadané podľa chronologických kritérií. Prvá časť je venovaná najstarším svedectvám vráteným z územia ebolitano: k dôkazom z obdobia neolitu nasleduje ilustrácia hrobiek nájdených v Madone della Catena a datovaných do obdobia eneolitu (facies takzvaný "Gaudo"). Dôkazy týkajúce sa doby bronzovej dokumentujú obsadenie kopcovitých oblastí malými osadami spojenými s praktikami transhumance a otvorenými kontaktom s vonkajšou stranou, o čom svedčí prítomnosť keramiky Mycenaean typu XI.
Druhá časť je venovaná výstave bohatých pohrebných súprav, ktoré od doby železnej preukazujú podstatnú kontinuitu okupácie osady Eboli až do rímskeho veku, keď Eboli (Eburum) preberá štatút municipia.
Okrem dokumentácie týkajúcej sa Eboli obsahuje trasa múzea príklad nálezov nachádzajúcich sa v meste Campagna a v Oliveto Citra.