Národní archeologické muzeum v Neapoli patří mezi nejstarší a nejdůležitější na světě pro bohatství a jedinečnost svého dědictví a pro jeho přínos pro evropskou kulturní scénu. Původ a formování sbírky jsou spojeny s postavou Karla III Bourbon, na trůn Neapolského Království z roku 1734 a jeho kulturní politika: král podporoval průzkum vesuviány měst pohřben erupci 79 d.C. (začala v roce 1738 v Herculaneum a v roce 1748 v Pompejích), a dohlížel na výstavbu ve městě do Muzea, Místo toho, převodem z rezidencí v Římě a Parma a je součástí bohaté kolekce dědí od matky Elisabetta Farnese.
To je vzhledem k jeho syna Ferdinanda IV plán, aby spolu v současné budovy, postavené na konci 1500 s cílem cavallerizza a od roku 1616 až do 1777 sídlo Univerzity, dvě jádra Farnese shromažďování a sběr Vesuv artefakty již vystavoval v Herculaneum Muzea uvnitř Paláce z Portici.
Od roku 1777 byla budova ovlivněna dlouhou fází rekonstrukcí a expanzních projektů, které byly svěřeny architektům F.Fuga a P. Schiantarelli. V dekádě francouzské nadvlády (1806-1815) byly provedeny první instalace a s návratem Bourbonů do Neapole v roce 1816 převzal jméno Real Museo Borbonico. Koncipován jako univerzální muzeum, to ubytovalo ústavy a laboratoře (Královská Knihovna, Akademie kreslení, papyri workshop...), později převedena na jiná místa v roce 1957.
Sbírky muzea, které se stalo národním v roce 1860, byly obohaceny získáním nálezů z vykopávek v místech Kampánie a jižní Itálie a ze soukromého sběru. Převod Pinacoteca na Capodimonte v roce 1957 určuje současnou fyziognomii archeologického muzea. Je zde cenné sbírky a archeologické nálezy rozlišit mezi pravěku a pozdně Římské věkové kategorie, do které jsou přidány více historické sbírky, včetně těch z Farnese, Borgia a sbírka starověkého Egypta.