Jako pierwsze i najbogatsze Muzeum Historii Naturalnej na Bałkanach, Narodowe Muzeum Historii Naturalnej w Sofii (NMNHS) bada, przechowuje i rozpowszechnia informacje o żywej i nieożywionej przyrodzie zarówno w Bułgarii, jak i na całym świecie.NMNHS jest jedyną instytucją krajową bezpośrednio zaangażowaną w ochronę zbiorów naukowych o żywej i nieożywionej naturze z Bułgarii i świata. Badania nad różnorodnością biologiczną, ochroną środowiska i ewolucją organizmów są głównymi priorytetami Muzeum. W związku z tym głównym zadaniem NMNHS jest wszechstronne badanie fauny, flory, skamieniałości, minerałów i skał Bułgarii i innych krajów. Rozwija następujące obszary naukowe: Taksonomia, faunistyka, zoogeografia i ekologia pajęczaków, miriapodów, owadów i wszystkich klas kręgowców; Taksonomia kopalnych ssaków, ptaków i ramienionogów; florystyka; Mineralogia.