Vybudování Studia nařídil císař Fridrich II. Švábský 5. června (podle některých zdrojů 5. července) 1224 okružním listem (generalis lictera) zaslaným ze Syrakus. Vzhledem k tomu, že Neapolská univerzita vznikla na příkaz samotného císaře, je absolutně považována za první světskou univerzitu v Evropě státního typu (tj. nezaloženou cechy nebo sdruženími intelektuálů či studentů, ale na základě panovnického dekretu).K vybudování Studia vedly císaře dva hlavní důvody: zaprvé výhradní vzdělávání administrativního a byrokratického personálu curia regis (vládnoucí vrstvy království), a tedy příprava právníků, kteří by panovníkovi pomáhali při definování státního zřízení a při výkonu zákonů; zadruhé usnadnit svým poddaným kulturní vzdělání a vyhnout se tak zbytečným a nákladným cestám do zahraničí.Volba sídla padla na Neapol, a to nejen z důvodů kulturních (město mělo v tomto ohledu dlouhou tradici, spojenou s postavou Vergilia, který je v jedné dobové listině výslovně připomínán), ale také geografických a ekonomických (rozhodující byl do jisté míry námořní obchod, mírné klima a strategická poloha v rámci království). Organizace Studium se opírala o práci dvou významných právníků z Kampánie: Piera delle Vigne a Taddea da Sessa.
