Neptūna alu vēsture aizsākās aizvēsturiskos laikos. Dažādas tajās atrastās neolīta perioda pēdas liecina, ka kopš to izveidošanās ir pagājuši aptuveni 2 000 000 gadu. Gandrīz droši var apgalvot, ka pirmatnējie cilvēki tās ir zinājuši un izmantojuši atbilstoši savām vajadzībām.Neptūna alas ir ne tikai slavenākās, bet arī lielākās. Tās stiepjas aptuveni 4 km garumā, bet drošības apsvērumu dēļ tūristiem ir atļauts piekļūt tikai daļai no tām. Papildus tam, ka Neptūna alas ir nozīmīgs tūrisma galamērķis un uzņem apmeklētājus no visas pasaules, tās ir arī iecienīts galamērķis speleologiem, kuri vienīgie var apmeklēt to slepenākos dziļumus.