História Neptúnových jaskýň siaha až do praveku. Rôzne stopy z obdobia neolitu, ktoré sa v nich našli, naznačujú, že od ich vzniku uplynulo približne 2 000 000 rokov. Je takmer isté, že pravekí ľudia ich poznali a využívali podľa svojich potrieb.Neptúnske jaskyne sú nielen najznámejšie, ale aj najväčšie. Tiahnu sa v dĺžke asi 4 km, ale z bezpečnostných dôvodov je turistom povolený prístup len do časti z nich. Okrem toho, že Neptúnske jaskyne sú významným turistickým cieľom a vítajú návštevníkov z celého sveta, sú aj obľúbeným cieľom speleológov, ktorí ako jediní môžu navštíviť ich najtajnejšie zákutia.
