Neptuni koobaste ajalugu ulatub tagasi eelajaloolistesse aegadesse. Neoliitikumi ajastusse kuuluvad jäljed, mis on leitud neoliitikumist, viitavad sellele, et nende tekkimisest on möödunud umbes 2 000 000 aastat. On peaaegu kindel, et ürgsed inimesed tundsid neid ja kasutasid neid vastavalt oma vajadustele.Neptuni koopad ei ole mitte ainult kõige kuulsamad, vaid ka suurimad. Need ulatuvad umbes 4 km pikkuseks, kuid turvalisuse huvides on turistidele lubatud juurdepääs vaid osale neist. Lisaks sellele, et Neptuni koopad on oluline turismisihtkoht, kuhu saab tulla külastajaid üle kogu maailma, on need ka populaarne sihtkoht speleoloogidele, kes on ainsad, kes saavad külastada nende kõige salajasemaid süvendeid.