Ninnaji és un dels grans temples de Kyoto, que estan catalogats com a Patrimoni Mundial de la humanitat. És el cap del temple de la Omuro Escola de la secta Shingon del Budisme i va ser fundada en 888 per l'emperador regnant. Al llarg de molts segles, un membre de la Família Imperial usa per a servir com Ninnaji cap sacerdot, i el temple també va ser coneguda com Omuro Palau Imperial.
A causa de les moltes guerres i els incendis que van assolar Kyoto al llarg de la seva història, cap de les naus del temple de la fundació en el segle 9 encara perduren. Els edificis més antics es remunten a l'inici del Període Edo a principis 1600s, incloent-hi la sala principal (Kondo), el Kannon de l'Ajuntament, el Niomon porta principal, la Chumon interior de la porta de brandenburg i el cinc pisos pagoda.
