Ninnaji ni moja ya wengi mahekalu kubwa katika Kyoto ambayo ni waliotajwa kama Urithi wa Dunia. Ni kichwa hekalu ya Omuro Shule ya Shingon madhehebu ya Ubuddha na ilianzishwa katika 888 na kutawala mfalme. Zaidi ya karne nyingi, mwanachama wa Familia Imperial kutumika kutumikia kama Ninnaji mkuu kuhani, na hekalu ilikuwa pia inajulikana kama Omuro Imperial Palace.
Kutokana na vita vingi na moto kwamba ravaged Kyoto katika historia yake, hakuna hata mmoja wa majengo kutoka hekalu ya msingi katika karne ya 9 bado kuishi. Zamani majengo ya tarehe nyuma ya mwanzo wa Edo mapema 1600, ikiwa ni pamoja na ukumbi wa kuu (Kondo), Kannon Hall, Niomon mbele ya lango, na Chumon ndani ya lango na tano storied hekalu.