O Antonian museo, reaberto en 1995, ofrece un único percorrido entre os tesouros artísticos feito, ao longo dos séculos, para a Basílica e para o venerable Arca de St Anthony: pinturas, esculturas, revocos, sagrado paramentos, tapicerías, Ourives, ata hoxe pouco accesible para o público. Están expostos a auténticas obras mestras da arte: o lunette frescoed por Mantegna para o portal da Basílica,as incrustacións de madeira do século Xv, o precioso Barco de arte dos ourives alemán Cinqucento, o altar-pezas por Tiepolo e Piazzetta, unha rara litúrxicas vestimenta tecidos en Lyon no século Xviii.