A orixe do Santuario de San Michele pódese situar entre finais do século V e principios do VI. As fontes escritas antigas así o testemuñan: unha carta enviada polo papa Gelasio I en 493/494 a Giusto, bispo de Larino, outra carta do mesmo Pontífice a Herculencio, bispo de Potenza (492 - 496) e outra nota máis informada no Martiroloxía Jerónimo baixo a data do 29 de setembro.Pero é o Liber de apparition saints Michaelis no Monte Gargano, cuxa redacción se remonta ao século VIII, o que reconstrúe de forma precisa e suxestiva os feitos milagrosos que orixinaron o culto ao Arcanxo Miguel no Gargano. Vincúlase á memoria de catro aparicións acontecidas ao longo dos séculos, que se narran cunha vivacidade extraordinaria e conmovedora e dan fe dos milagrosos acontecementos que aquí aconteceron.A cova sagrada foi escollida dende hai séculos como destino de peregrinacións, lugar de oración e sobre todo de reconciliación con Deus.As aparicións son en realidade un sinal, unha invitación ao home para que se incline ante a Divina Maxestade. Ao longo de quince séculos de historia, cristiáns de todo o mundo achegáronse ao Santuario do Gargano, "casa de Deus e porta do ceo", para atopar a paz e o perdón nos amorosos brazos do Pai e honrar ao Arcanxo San Miguel.Entrando polo portal románico, atopámonos no interior da basílica celeste, no lugar elixido por San Miguel. De toda a atmosfera do lugar sagrado emana un feixe escuro e misterioso que se materializa no xogo de luces e sombras entre os barrancos e na escintilante presenza da urna que encerra a estatua de San Miguel Arcanxo dunha expresividade incomparable. Un afán de abandono ao perdón divino colócase no corazón: é a invitación do Arcanxo guerreiro a superar as nosas debilidades e a retomar a nosa viaxe, fortalecidos polo perdón de todos os nosos pecados. A Igrexa, non consagrada por mans humanas, divídese claramente en dúas partes: unha nada máis entrar, construída en cachotería, chamada nave anxevina e outra en estado natural, cova aberta pola propia natureza na rocha calcaria.Nada máis entrar, á dereita, atopamos un pequeno altar, levantado na honra de San Francisco: lembra a súa visita ao noso Santuario, feita aló polo ano 1216.Segundo se transmite, San Francisco, chegando ao Monte Sant'Angelo para conseguir o perdón anxelical, sen sentirse digno de entrar na Gruta, detívose na entrada en oración e recollemento, bicou o chan e gravou o sinal da cruz unha pedra en forma de "T" (tau). Na linguaxe bíblica o signo "T" era un símbolo de salvación. Desta historia podemos entender canta importancia lle atribuíu o Poverello de Asís a esta Gruta para a especial dignidade do lugar sagrado e para a salvación das almas. Despois duns pasos pasado o altar de San Francisco, ábrese ante o visitante un espectáculo único no seu xénero: a cova, de bóveda rochosa irregular, que ao longo dos séculos acolleu a millóns de peregrinos, lugar onde atoparon moitos pecadores. perdón e paz. Alí, o crente séntese como o fillo pródigo que regresa á casa do Pai, guiado e protexido por San Miguel.O interior desta cova, consagrada non pola man humana senón polo propio San Miguel (como declarou nunha das súas aparicións), testemuña a historia centenaria cos seus diversos elementos.Aquí podemos admirar as seguintes obras: No presbiterio: a estatua de San Miguel protector deste lugar sagrado, obra de Andrea Contucci tamén coñecida como Sansovino (1507), tallada en mármore branco de Carrara que representa ao Príncipe das milicias celestes, en actitude de guerreiro que pisotea a Satanás baixo o disfraz de monstro, a cátedra episcopal (primeira metade do século XI), a estatua de San Sebastián (século XV), A carón do presbiterio: o altar da Nosa Señora do Perpetuo Socorro (un dos máis antigos da Basílica Celeste), o alto relevo das SS. Trindade, a estatua da Virxe chamada de Constantinopla, o baixorrelevo de San Mateo apóstolo e evanxelista. Nunha pequena cova, chamada del Pozzetto, un simulacro de pedra de San Miguel do século. XV Unha cavidade da cova chamada canteira de pedras nunha saída de emerxencia. Continuando, observamos o trono real e dous altares con dosel: do Crucifixo e de San Pedro. AS CRIPTASA parte máis suxestiva dos antigos edificios do santuario son as Criptas. Estas estancias remóntanse á época lombarda e saíron á luz tras as escavacións promovidas por Mons. Nicola Quitadamo nos anos 1949-1960. No seu día serviron de entrada á Gruta e foron definitivamente abandonadas no século XIII, na época das construcións anxevinas. Numerosas inscricións ao longo dos muros das "criptas", algunhas en caracteres rúnicos, testemuñan a considerable afluencia de peregrinos de toda Europa desde a época lombarda.As criptas están formadas por dúas estancias cuxas estruturas deben ter sido construídas en dúas fases inmediatamente sucesivas. Algunhas inscricións murales identificadas en 1974 permitiron datar os edificios entre finais do século VII e principios do VIII.As criptas, duns 60 metros de lonxitude, esténdense ata o piso da basílica. A primeira parte ten forma de galería porticada, dividida en oito vans rectangulares. Neste ambiente evocador expuxéronse diversas esculturas das escavacións do santuario, da antiga igrexa de S. Pietro e das ruínas da abadía beneditina de S. Maria di Pulsano. Todos os achados aquí expostos pódense datar dende o século VII-VIII ata o século XV. Visitando o museo pódense admirar varias esculturas que testemuñan unha vez máis a gloriosa historia deste lugar.Pasando polo oco escavado no muro de contención, atopámonos na outra sala de época longobarda, (con evidentes vestixios de construcións prelombardas) dividida en dúas grandes naves, marcadas por un voo central de tres arcos de medio punto, e delimitada. ao norte e ao sur por outros tantos arcos sostidos por macizos piares. Os corredores estaban ocupados por escaleiras: a da dereita, de tendencia curvilínea, consérvase totalmente ao seu paso; o da esquerda, que vai recto, foi destruído durante as obras. As dúas escaleiras remataban nunha pequena caseta, limitada ao leste por unha ábsida, cun altar de bloque en sillares cadrados, con vestixios de numerosas inscricións. Á esquerda do altar, protexido por lousas de pedra, atopouse un fresco chamado Custos Ecclesiae que se pode atribuír ao século X. Polos restos dos frescos e polas numerosas inscricións murais podemos entender a importancia do Santuario. , especialmente para os lombardos.Estes ambientes foron definitivamente separados da Gruta Sagrada arredor dos anos 1270-1275, cando os anxevinos, coas novas edificacións, deron ao Santuario a estrutura actual, sacrificando as obras anteriores erixidas en honra a San Michele Arcangelo.