Ostrov Caprera je úplne zahrnutý do súostrovia národného parku La Maddalena, morskej a suchozemskej chránenej oblasti národného záujmu a záujmu Spoločenstva. Má zubatý a trhaný pobrežný vzor. Východná časť pobrežia je obzvlášť ťažko dosiahnuteľná, pretože je chránená malým reťazcom ružovej žuly. Pobrežná oblasť východnej strany je veľmi strmá, čiastočne pokrytá borievkami, masticovými stromami a inými typickými exemplármi stredomorského maquisu. Smerom na západ svah ustupuje plochým plochám, tiež stredomorským makistom, kde sa nachádza aj rozsiahly borovicový les. Divoká a nepoškvrnená povaha ostrova určila v roku 1982 vyhlásenie prírodnej rezervácie, po ktorej nasledovalo jej zaradenie do Národného parku La Maddalena. Osobitná naturalistická a environmentálna hodnota znamenala, že väčšina východného pobrežného úseku, takzvaná zóna a, je pod integrálnym ochranným režimom, ktorý zakazuje vykonávanie rybolovu pred Cala Coticcio. Tento zákaz sa vzťahuje aj na morskú oblasť východne od Punta Rossa a Isola Pecora. V zime môže byť oblasť stále preskúmaná autom, ale v lete je zakázané prechádzať tam, pokiaľ nie je povolenie udelené obcou a úradom parku. Ostrov Caprera, ako aj jeho prírodné krásy, je známy tým, že si zachováva spomienku na dvadsaťšesť rokov, ktoré sa Giuseppe Garibaldi rozhodol stráviť tam: navštíviť kompendium Garibaldi s hrobkou a Bielym domom, jeho bydlisko až do svojej smrti. Na ostrove sa tiež nachádza škola plachtenia: plachtárske centrum caprera.
