Ostrov Fraser bol v roku 1992 zapísaný na zoznam svetového dedičstva UNESCO ako uznanie jeho prírodných hodnôt.
Oficiálna citácia vzdáva hold ostrovu "" a odvoláva sa na "viac ako 250 km piesočnatých pláží s dlhými, neprerušovanými oceánskymi plážami, s viac ako 40 km nápadne sfarbených piesočných útesov, ako aj veľkolepými dunovými výbežkami a plážami s oceánskym príbojom; vysoké dažďové pralesy rastúce na piesku s nízkym obsahom živín; dunové jazerá s čistou "bielou vodou" aj tmavou "čiernou vodou"; banksijské lesy, vresoviská, vzorkované močaristé slatiny a chránené mangrovové oblasti vo veľkolepej "mozaikovitej krajine"."
Ostrov Fraser poskytuje celosvetovo významný príklad geologických procesov a biologickej evolúcie vrátane: komplexných pobrežných dunových útvarov, ktoré sa stále vyvíjajú; množstva jazier, ktoré sú výnimočné z hľadiska počtu, rozmanitosti, veku a dôkazov dynamických a vývojových štádií; a vynikajúcich príkladov ekosystémov, ktoré sa vyvinuli ako reakcia na morské podmienky a chudobné pôdy v pobrežných dunových útvaroch.
Celý ostrov je súčasťou Národného parku Great Sandy (okrem voľných oblastí, ako sú mestské štvrte) a je chránený podľa zákona o ochrane prírody z roku 1992 a zákona o správe rekreačných oblastí z roku 2006 až po úroveň hladiny spodnej vody.