Den grandest, den sista och bäst bevarade av tempel i Paestum är den så kallade tempel Neptunus, även om det var nästan säkert tillägnad, liksom basilikan, Hera. Detta erkändes från den första som den största av alla tempel och det antogs därför på artonhundratalet att det måste ha varit tillägnad beskyddare gud staden som var Poseidon, gud havet. Det ursprungliga grekiska namnet för Paestum var Poseidonia, och de tidiga mynten har bilden av Poseidon: Paestum är faktiskt det romerska namnet på webbplatsen. Poseidonia är staden Poseidon vars latinska motsvarighet är Neptunus och därför namngavs Neptunus tempel. Engagemanget är nästan säkert fel eftersom terracotta votive-figurerna som finns i helgedomen visar kvinnliga typer som normalt identifieras som Hera. Det finns också en inskriven silverfat som förklarar "Jag är helig för Hera: stärka våra bågar".
