Cel mai mare, ultimul și cel mai bine păstrat dintre templele de la Paestum este așa-numitul templu al lui Neptun, deși a fost aproape sigur dedicat, ca Bazilica, Hera. Acest lucru a fost recunoscut de la început ca fiind cel mai mare dintre toate templele și, prin urmare, sa presupus în secolul al XVIII-lea că trebuie să fi fost dedicat zeului patron al orașului, care era Poseidon, zeul mării. Numele grecesc original pentru Paestum a fost Poseidonia, iar primele monede au imaginea lui Poseidon: Paestum este de fapt numele Roman al site-ului. Poseidonia este orașul Poseidon al cărui echivalent Latin este Neptun și, prin urmare, a fost numit Templul lui Neptun. Dedicarea este aproape sigur greșită, deoarece figurinele votive din teracotă găsite în sanctuar arată tipuri de femei identificate în mod normal ca Hera. Există, de asemenea, un vas de argint înscris care declară "sunt sacru pentru Hera: întăriți arcurile noastre".
