Iš pradžių pastatas buvo pastatytas deivės Atėnės, miesto globėjos, garbei. Atėnės Mergelės šventykla (Parthenonas yra Graikiškas žodis Mergelė) buvo pastatytas po persų karų miesto pergalės dėka. Jis buvo pastatytas ankstesnės šventyklos vietoje, kurią Persai sunaikino. Pasikeitus valdovams ir okupantams, šventykla buvo naudojama įvairiems tikslams, įskaitant bažnyčią, mečetę ir tvirtovę.
Statant Partenonas architektas Entasis panaudojo optines iliuzijas, kad sukurtų lengvą ir padidintą įspūdį. Kolonų pagrindas, stilobatas, šiek tiek lenkiasi į viršų, o kolonos šiek tiek išsipučia kylant, taip sukuriant simetriškesnį įspūdį, kai žiūrite į pastatą. Partenono pagrindas yra 30,9 metro ir 69,5 Metro; cella (vidinė kamera) buvo 29,8 metro ir 19,2 metro; buvo dvi doriškų kolonų kolonados, palaikančios stogą. Iš pradžių Partenonas būtų buvęs nudažytas šviesiai mėlynomis lubomis ir statulomis ryškiomis spalvomis. Šiandien mes galime pamatyti tik baltą marmurą.
5-ojo amžiaus skulptorius Phidias perėmė dekoraciją,o centrinis kūrinys buvo 12,19 metro aukščio Atėnės skulptūra. Iki 438 m. pr. m. e. pastatas buvo baigtas statyti, tačiau apdaila tęsėsi dar 5 metus. Deja, skirtingais laikais buvo atlikti struktūriniai pokyčiai, kad būtų galima pritaikyti besikeičiančias pastato funkcijas. Pavyzdžiui, vidinės kolonos buvo pašalintos, kad šventykla taptų bažnyčia, o pavertus mečete, buvo pridėtas minaretas. Struktūra nukentėjo nuo vandalų, stichinių nelaimių ir turistų, kurie pavogė šventyklos gabalus namo. 1687 m. Partenono stogas buvo sunaikintas, kai venecijiečiai užpuolė miestą, o besiginantys Osmanai pavertė jį ginklų miltelių saugykla. Sprogo apvalkalas, padaręs nepataisomą žalą. Lordas Elginas vaidino svarbų vaidmenį Partenono "išprievartavime", kai jis nunešė nemažą dalį skulptūrų ir architektūros kūrinių. Ši kolekcija, žinoma kaip Elgin Marbles, dabar eksponuojama Londono Britų muziejuje. Kitos skulptūros baigėsi Paryžiuje ir Kopenhagoje. Daugelį Partenono skulptūrų galima pamatyti Akropolio muziejuje Atėnuose.
1832 m. įkūrus Graikijos valstybę, buvo pašalinti naujausi architektūriniai papildymai ir atkurta didžioji dalis Akropolio ir Partenono.
