Bina aslen şehrin patronu tanrıça Athena'nın onuruna inşa edilmiştir. Bakire Athena Tapınağı (Parthenon, bakire anlamına gelen Yunanca kelimedir), kentin zaferi sayesinde Pers Savaşlarının ardından inşa edilmiştir. Perslerin yıktığı daha önceki bir tapınağın yerine inşa edilmiştir. Hükümdarlar ve işgalciler değiştikçe tapınak kilise, cami ve kale gibi farklı amaçlar için kullanıldı.
Parthenon'un yapımında mimar Entasis, hafif ve yüksek bir izlenim yaratmak için optik yanılsamalar kullandı. Sütunların tabanı olan stylobat hafifçe yukarı doğru kıvrılır ve sütunlar yükseldikçe hafifçe şişer, böylece yapıya baktığınızda daha simetrik bir izlenim yaratır. Parthenon'un tabanı 30.9 metre x 69.5 metre; cella (iç oda) 29.8 metre x 19.2 metre; çatıyı destekleyen iki sütunlu Dor sütunu vardı. Başlangıçta Parthenon açık mavi tavanlarla ve heykeller parlak renklerle boyanacaktı. Bugün sadece beyaz mermeri görebiliyoruz.
Dekorasyondan 5. yüzyıl heykeltıraş Phidias sorumluydu ve merkez parça 12.19 metre yüksekliğindeki Athena heykeliydi. M.Ö. 438de bina tamamlandı, ancak dekorasyon 5 yıl daha devam etti. Ne yazık ki, binanın değişen işlevlerine uyum sağlamak için farklı dönemlerde yapısal değişiklikler yapıldı. Örneğin tapınağın kiliseye dönüştürülmesi için iç sütunlar kaldırılmış ve camiye dönüştürüldüğünde minare eklenmiştir. Yapı, vandalların, doğal afetlerin ve tapınağın parçalarını eve götürmek için çalan turistlerin elinde acı çekti. 1687'de Venedikliler şehre saldırınca Parthenon'un çatısı yıkıldı ve savunan Osmanlılar burayı barut deposuna çevirdi. Bir kabuk onarılamaz zarar patladı. Lord Elgin, heykellerin ve mimari eserlerin büyük bir bölümünü taşırken Parthenon'un "tecavüzünde" önemli bir rol oynadı. Elgin Mermerleri olarak bilinen bu koleksiyon şimdi Londra British Museum'da sergileniyor. Diğer heykeller Paris ve Kopenhag'da sona erdi. Parthenon heykellerinin çoğu Atina'daki Akropolis Müzesi'nde görülebilir.
1832'de bir Yunan Devletinin kurulmasından sonra, daha yeni mimari eklemeler kaldırıldı ve Akropolis ve Parthenon'un çoğu restore edildi.
