Istoria Peșterilor Neptun datează din vremuri preistorice. Diverse urme, aparținând perioadei neolitice, găsite în interiorul lor sugerează că au trecut aproximativ 2.000.000 de ani de la formarea lor. Este aproape sigur că oamenii primitivi le cunoșteau și le foloseau în funcție de propriile nevoi.Peșterile Neptun nu sunt doar cele mai faimoase, ci și cele mai mari. Ele se întind pe o lungime de aproximativ 4 km, însă, din motive de securitate, turiștii nu au acces decât la o parte dintre ele. Pe lângă faptul că sunt o destinație turistică importantă și primesc vizitatori din întreaga lume, Peșterile Neptun sunt, de asemenea, o destinație populară pentru speologi, care sunt singurii care pot vizita cele mai secrete ascunzișuri ale acestora.