Petro įkūrė 7-ojo amžiaus pabaigoje Amandus, misionierius, kurį frankų karaliai pasiuntė Krikščioninti pagonių regiono gyventojų, kurie šioje srityje įkūrė du vienuolynus, Šv. 879-80 m. žiemą abatiją užpuolė ir apiplėšė Normanai, ir ji išliko palyginti skurdi iki 10 amžiaus, kai grafo Arnulfo I turto ir relikvijų aukos ją žymiai praturtino, kaip ir tolesnės Arnulfo pusbrolio Karaliaus aukos Edgaras iš Anglijos. Antroje amžiaus pusėje tai buvo turtingiausia abatija Flandrijoje, o abatijos mokyklos reputacija išsiplėtė toli už miesto. 984 m. Gerbertas iš Aurillaco, Reimso katedros mokyklos direktorius (vėliau Popiežius Sylvesteris II) teiravosi, ar Reimso studentus galima priimti į Šv. Petro nuosavybė už didelius žemės plotus taip pat vaidino novatorišką vaidmenį auginant 12 ir 13 amžiuje, paversdama miškus, pelkes ir pelkes dirbama žeme. 15 amžiuje plataus masto statybos programa sukūrė abatijos biblioteką ir scriptorium, išplėtė valgyklą, o abatijos bažnyčia ir kiti pastatai buvo gerokai pagražinti. Petro pirmasis nuosmukis prasidėjo po Gento sukilimas 1539 m., o 1560-aisiais Žemosios šalys buvo pasinėrusios į religinę krizę, dėl kurios 1566 m.ikonoklastai užpuolė, kai abatijos bažnyčia buvo sudaužyta, biblioteka apiplėšta ir kiti pastatai smarkiai apgadinti. Ligoninė buvo pradėta eksploatuoti kaip laikini vienuolių namai, o valgykla buvo naudojama kaip garbinimo vieta. Tačiau opozicija tęsėsi ir 1578 m. abatas ir vienuoliai buvo priversti bėgti į Douai. Abatijos pastatai buvo parduoti viešame aukcione ir buvo iš dalies nugriauti, medžiagos buvo naudojamos miesto sienoms statyti. Abatija pagaliau grįžo į bažnyčios rankas 1584 m., ir galiausiai ji buvo atstatyta su nauja abatijos bažnyčia, pradėta 1629 m., baroko stiliumi, taip pat keletu kitų naujų pastatų ir atnaujinimų. 18 amžiuje abatija vėl klestėjo, nes buvo pastatyti nauji pastatai ir išplėsti senesni pastatai, įskaitant senojo bendrabučio pavertimą biblioteka, kurioje yra daugiau nei dešimt tūkstančių knygų. Tačiau pabaiga nebuvo toli, pirmiausia su Brabanto revoliucija 1789-90 m., paskui Prancūzijos invazija 1793 m. Galiausiai, 1 rugsėjo 1796, katalogas panaikino visas religines institucijas. 1798 m. biblioteka buvo ištuštinta ir galiausiai išvežta į Gento universitetą. Nuo 1798 m. abatijos bažnyčia buvo naudojama kaip muziejus, tačiau 1801 m.ji buvo grąžinta bažnyčios nuosavybei. 1810 m. likusi abatijos dalis tapo Gento miesto nuosavybe ir buvo iš dalies nugriauta statant karines kareivines, kurios toje vietoje liko iki 1948 m. Apie 1950 m. miestas pradėjo vis dar vykdomą restauravimo programą, kuri prasidėjo nuo vienuolyno ir skyriaus namo, paskui vakarinio sparno, įskaitant senąją valgyklą ir virtuves. Darbas vyno rūsiuose ir palėpėse buvo baigtas 1970-aisiais, o 1982 m. buvo baigtas darbas abatijos soduose, o 1986 m. - terasa. 1990-aisiais prasidėjo refektorijos sparno restauravimas. Abatija dabar naudojama kaip muziejus ir parodų centras, kuriame 2000 m. vyko pagrindinė paroda kaip imperatoriaus Karolio metų dalis, o 2001 m.spalio mėn 88-asis Europos Vadovų Tarybos susitikimas.