Etruskide nimi ei ole teada, võib-olla pärineb see Statnes'ist (või Staties'ist), millest Rooma ajal sai prefektuur ja mida nimetati Statonia'ks.Pitigliano nimi näib hoopis tulenevat gens Petilia'st, mis oli oluline Rooma perekond, mis andis nime mitmele paikkonnale. Vana legendi kohaselt on linna asutamine väidetavalt tingitud kahest roomlasest: Petilio ja Celiano; nende nimede liitmisest tuleneb Pitigliano.Nimetus "Väike-Jeruusalemm" seevastu tuleneb sajandite jooksul olulise juudi kogukonna olemasolust.Pitiglianos, mis on piirkonna ainus "põgenikelinnade" pärija, võimaldasid sajandite jooksul säilinud soodsad tingimused arendada erakordset kooselu ja sallivust juudi ja kristliku elanikkonna vahel, nii et linna nimetati "Väike-Jeruusalemmaks". Kristlaste ja juutide vahelised erakordsed suhted kinnistati lõplikult 1799. aastal toimunud ainulaadse episoodiga, kui rahvas ja kristlik enamus kaitsesid iisraellasi gettot rüüstata soovinud prantsusevastaste sõdurite kuritarvituste eest.Ajalugu300-1000 eKr. on dokumenteeritud pronksiaegne küla, kuid Pitigliano kalju, nagu ka kogu Fiora jõe org, oli külastatud juba neoliitikumis (6. aastatuhandel eKr.) ja seejärel vaseajal.8. sajandil eKr saavutas etruskide asula tänu lähedalasuvale Veio linnale oma kõrgpunkti 6. sajandil eKr, asendades lähedalasuva Poggio Buco keskuse Fiora jõel, kust leiti nekropol ja templi jäänused; umbes 500 eKr hävitas selle tõenäoliselt Chiusi kuningas Porsenna.I sajand eKr - II sajand pKr, Rooma kohalolekust koos talude ja küladega piki peateid näitavad mitmesugused ehitised Pitigliano kalju vastas asuval platool.1061. aastal esineb toponüüm Pitigliano esmakordselt Nikolai II poolt Sovana kanoonikutele antud bullas.1188. aastal ilmub Pitigliano ühes teises dokumendis kui castro (kindlustatud küla), mis kuulus Aldobrandeschi krahvidele, kes olid kogu Maremma valitsejad ja kellele see kuulus vahetult pärast 1000. aastat.1274. aastal esineb Pitigliano kui üks Aldobrandeschi krahvkonna peamisi linnuseid sõdades Orvieto kommuuniga.1313, Orsini järgnesid Aldobrandeschidele abielu kaudu Sovana maakonnas; sunnitud pikaajalistesse võitlustesse esmalt Orvieto ja seejärel Siena kommuunidega, pärast seda, kui viimased vallutasid 1410. aastal peaaegu kogu Maremma, sealhulgas Sovana, viisid Orsini maakonna pealinna Pitiglianosse.1466. aastal sai Pitigliano väike maakond tugevamaks, kui võimule tuli Itaalia suurriikide teenistuses olnud varakapten Niccolò III; koos temaga rikastati Pitigliano renessansiaegsete monumentidega, mille kallal töötasid sellised kunstnikud nagu Antonio da Sangallo, Baldassare Peruzzi ja Anton Maria Lari.1604 ostab Toscana suurhertsog Ferdinando I kõik Orsini valdused: sellega lõpeb Pitigliano krahvkond; sajandi keskpaigast alates hakkab kasvama juutide arv, kes leiavad siin turvalist varjupaika; 1643. aastal nurjavad Mediciidid paavsti vägede okupatsioonikatset.1843 saab Pitigliano linna tiitli, kui Sovana piiskopkond läheb üle ja tänu valgustusreformidele järgnenud majanduskasvule.