Porto Santo Stefano apbūvētā teritorija attīstās gar divām ostām. Tirdzniecības osta, kas ir lielākā, ir pirmā, kurā iebraucot pilsētā, tajā piestāj zvejas kuģi un piestāj prāmji uz Džiljo un Džannutri salām. Savukārt mazā Pilarella osta ir vieta, kur Porto Santo Stefano var pastaigāties un atpūsties. Uz turieni var nokļūt, ejot pa Giorgetto Giugiaro projektēto promenādi, kur no bāru un mazo restorānu galdiņiem paveras skats uz jūru, un jūs varēsiet mierīgi nobaudīt vietējās virtuves ēdienus, vienlaikus vērojot šī burvīgā piejūras ciemata panorāmu. Pateicoties izcilajam ģeogrāfiskajam stāvoklim, to noteikti apmeklēja jau senās tautas, kas kuģoja pa Vidusjūru. Tomēr tikai romieši ir atstājuši taustāmas pēdas par savu tālo klātbūtni, tostarp imperatora villu Domizi Enobarbi no 1. gadsimta p. m. ē. Romieši savās kartēs Porto S. Stefano dēvēja ar dažādiem nosaukumiem, piemēram, Portus Traianus, Portus ad Cetarias vai Portus Incitaria. Sjēnas kundzības laikā no 15. gadsimta sākuma līdz 16. gadsimta vidum Porto S. Stefano bija tikai nenozīmīga osta, kas bieži bija pakļauta pirātu uzbrukumiem. No šī perioda datējama Argentiera torņa (iespējams, 1442. gadā) un dažu piekrastes torņu celtniecība. Centra attīstība sākās tikai ap 1550. gadu spāņu gubernatora Nunez Orejon de Avila laikā un turpinājās līdz ar Prezidija valsts izveidi un spāņu cietokšņa celtniecību (17. gadsimta sākumā), lai kontrolētu ostu. Porto S. Stefano 1646. gada 9. maijā iekaroja franči, bet tā paša gada jūlijā Porto S. Stefano atkal nonāca Spānijas pakļautībā. 1707. gadā kopā ar visu Stato dei Presidi to iekaroja austrieši, 1737. gadā tas piederēja Burbonu valdījumā, un šajā laikā notika pirmā demogrāfiskā attīstība, ko izraisīja daudzu ģimeņu no Neapoles, Elbas salas un Ligūrijas apmešanās. 1801. gadā to pievienoja Etrurijas karalistei, bet 1815. gadā ar Vīnes līgumu to piešķīra Toskānas Lielhercogistei. 1842. gadā lielhercogs Leopolds II izveidoja Monte Argentario kopienu, kurā Porto Santo Stefano bija galvaspilsēta, bet Porto Ercole - ciemats. Visbeidzot, 1860. gadā kopā ar visu Toskānu tā pievienojās Itālijas karalistei. Spāņu cietoksnis ir visinteresantākā pilsētiņas ēka; to uzcēla don Parafana de Ribera vietvalža laikā, un, ņemot vērā ierobežoto apmešanās vietai atvēlēto platību, tam, visticamāk, bija vairāk novērošanas nekā aizsardzības funkcija.Bez jau minētā Torre dell'Argentiera, kas atrodas tālu no jūras un atrodas uz tāda paša nosaukuma kalna, ir arī vairāki piekrastes torņi; tas ir 25 metrus augsts, tam ir kvadrātveida plānojums, un tajā nav ieejas durvju, bet tikai viena eja sienas vidū. Līdz Otrā pasaules kara beigām galvenie Santo Stefano ekonomikas avoti bija lauksaimniecība, zvejniecība un kuģniecība. Tomēr kopš 20. gadsimta 60. gadiem tūrisma nozare ir ievērojami attīstījusies, kļūstot par galveno pilsētas ekonomikas avotu.