Porto Santo Stefano hoonestatud piirkond areneb mööda kahte sadamat. Suurem kaubasadam on esimene sadam, kuhu jõuate linna sisenedes; seal silduvad kalalaevad ja silduvad parvlaevad Giglio ja Giannutri saartele. Pilarella väike sadam on seevastu Porto Santo Stefanos jalutuskäigu ja lõõgastumise koht. Sinna pääseb mööda Giorgetto Giugiaro kujundatud promenaadi, mille baaride ja väikeste restoranide laudadest avaneb vaade merele ja kus saab täiesti rahulikult maitsta kohalikku kööki, imetledes samal ajal selle lummava mereäärse küla panoraami. Tänu oma suurepärasele geograafilisele asendile külastasid seda kindlasti juba iidsed rahvad, kes seilasid mööda Vahemerd. Ainult roomlased on aga jätnud oma kaugest kohalolekust käegakatsutavaid jälgi, sealhulgas Domizi Enobarbi keiserliku villa 1. sajandist eKr. Roomlased nimetasid Porto S. Stefanot oma kaartidel erinevate nimedega, näiteks Portus Traianus, Portus ad Cetarias või Portus Incitaria. Sienalaste võimu all 15. sajandi algusest kuni 16. sajandi keskpaigani oli Porto S. Stefano vaid tähtsusetu sadam, kus sageli toimusid piraatide röövretked. Argentiera torni (tõenäoliselt 1442. aastal) ja mõnede rannikutornide ehitamine pärineb sellest perioodist. Keskuse areng algas alles 1550. aasta paiku Hispaania kuberner Nunez Orejon de Avila ajal ning jätkus paralleelselt Presidi riigi loomisega ja Hispaania kindluse ehitamisega (17. sajandi alguses) sadama kontrollimiseks. 9. mail 1646 vallutasid Porto S. Stefano prantslased ja sama aasta juulis läks see tagasi Hispaania võimu alla. 1707. aastal vallutasid selle koos kogu Stato dei Presidiga austerlased, 1737. aastal kuulus see Bourbonidele ja sel perioodil toimus esimene demograafiline areng, mis tulenes paljude Napolist, Elba saarelt ja Liguuria saarelt pärit perekondade ümberasumisest. 1801. aastal liideti see Etruria kuningriigiga ja 1815. aastal Viini lepinguga anti see Toscana suurhertsogiriigile. 1842. aastal asutas suurhertsog Leopold II Monte Argentario kogukonna, kus Porto Santo Stefano esindas pealinna ja Porto Ercole küla. Lõpuks 1860. aastal ühines see koos kogu Toscanaga Itaalia Kuningriigiga. Hispaania linnus on linna kõige huvitavam hoone; see ehitati Don Parafan de Ribera varakuningriigi ajal ja arvestades piiratud ruumi, mis oli majutuseks mõeldud, oli sellel tõenäoliselt pigem vaatlus- kui kaitsefunktsioon.Lisaks eelmainitud Torre dell'Argentiera tornile on veel mitu rannikutorni, mis asuvad merest kaugel samanimelisel künkal, on 25 meetri kõrgune, ruudukujulise plaaniga ja millel puuduvad sissepääsuuksed, vaid ainult üks avaus müüri keskel. Kuni Teise maailmasõja lõpuni olid Santo Stefano peamised majandusallikad põllumajandus, kalandus ja laevandus. Alates 1960ndatest aastatest on aga turismisektor märkimisväärselt arenenud, muutudes linna majanduse peamiseks allikaks.