Okupācijas muzejs tika atvērts 2003. gada 1. jūlijā, un tas ir veltīts 1940. -1991. gada periodam Igaunijas vēsturē, kad valsti okupēja Padomju Savienība, pēc tam nacistiskā Vācija un pēc tam atkal Padomju Savienība. Šajā laikā valsts bija pazīstama kā Igaunijas Padomju Sociālistiskā Republika.