A Pythagorion Régészeti Múzeumban mintegy 3000 tárgyat őriznek, amelyeket az ókori Szamosz városában és a sziget más részein végzett ásatások során találtak. Ezek a kiállítási tárgyak a sziget történelmi fejlődését mutatják be a Kr. e. 5. évezredtől a Kr. u. 7. századig, és bemutatják Szamosz politikai jelentőségét az ókorban.
A múzeum c"nekrodeipna" gyűjteménye egyedülálló kincsként emelkedik ki. Ezek olyan domborművek, amelyek temetési lakomákat ábrázolnak, és betekintést nyújtanak az ősi temetkezési szokásokba és hiedelmekbe. A múzeum kínálatát tovább gazdagítja a Kr. e. 9. századtól a Kr. e. 2. századig terjedő időszakból származó kerámiák széles választéka.
A kihagyhatatlan kiállítási tárgyak között szerepelnek:
Egy márványból készült ülő Aeaces-szobor, amely Kr. e. 540 körül készült. A feliratból kiderül, hogy Aeaces, Polikratész apja Héra istennőnek szentelte. Érdekes módon az alkotást Aeaces kalózkodásból szerzett vagyonából finanszírozták.
Egy nagyszerű márvány szarkofág, amelyet úgy alakítottak ki, hogy egy templomszerű építményre hasonlítson, és a Kr.e. 6. század második feléből származik.
Egy kisméretű, pálmás végződéssel díszített pórus sírstélé, melyen a "DIAGORO TO GDILO" felirat olvasható, Kr.e. 530-ból származik.
Egy másik márvány síremlék sztélé palmettás végződéssel, amelyet Chorában fedeztek fel, és Kr.e. 500/490-re datálható.
Trajanus római császár túlméretezett márványszobra, amely impozáns, 2,71 méter magas.
Augusztus és Claudius római császárok részletes, 0,49 méter, illetve 0,53 méter magas márványportréja.
Függetlenül attól, hogy történelemrajongó, művészetkedvelő vagy egyszerűen csak kíváncsi vagy a múltra, a Pitagoreio Régészeti Múzeum magával ragadó élményt nyújt. Minden egyes lelet elmesél egy történetet, kézzelfogható kapcsolatot kínálva az ókori világgal és a Szamoson nyomot hagyott számos civilizációval.
A múzeum kényelmes helyen található, mintegy 300 méterre a kikötőfronttól.
