За свідченням місцевого хроніста Франческо Серджіо, тут існувала василіанська спільнота під назвою Менна.Чернецтво, як повідомляє Дон Франческо Пульєзе у своїй книзі "Скеля і церква" (Uno Scoglio e una Chiesa), вже було засвідчене в околицях Тропеї: можливо, ця велика скеля, колись ще більша і оточена морем, приваблювала споглядальних духів, які шукали усамітнення. Церква Санта Марія де Тропеа, cum omnibus pertinentiis suis з'явилася "в списку залежностей Кассінського абатства", складеному на панелях бронзових дверей (відлитих, зокрема, в Константинополі) на замовлення абата Монтекассіно Дезідеріо (згодом Папи Віктора III).Посилаючись на різні розглянуті папські документи, Пульєзе зазначає, що якщо церква з'явилася на панелях вже в 11 столітті, то вона повинна була мати значне значення, контролювати помітні активи і, отже, існувала задовго до цього. Архітектурні зміни, яких будівля зазнала вже в гуманістичний період, однак, натякають на ранньосередньовічні візантійські риси, що підтверджує походження, пов'язане з невеликою василіанською чернечою спільнотою. Ця присутність, пов'язана з грецьким обрядом, повільно, але впевнено почала зникати після того, як інші місцеві об'єкти почали переходити у власність бенедиктинців-касинів (наприклад, невелика церква біля нинішньої Голгофи, подарована якимось Бернардо, або маєток під назвою Тоннара е Борділа з сусідньої Паргелії). За словами Пульєзе, цьому проходу сприяли "нормандські герцоги Січелгайта та її син Руджеро Борса", саме в той час, коли єпархія Амантеї була придушена, щоб бути включеною до єпархії Тропеї. "Келія" на скелі за часів монахів-василіян грецького обряду була місцем культу Мадонни, який перейшов до монахів-кассінезійців. Легенда, пов'язана з цією дерев'яною Мадонною, подібна до легенд інших святилищ на півдні Італії (див. розділ "Міфи та легенди"). Сходи, що ведуть до церкви, були збудовані шляхом викопування сходинок у скелі і завершені у 19 столітті. До теперішнього облаштування до сходів, ще не завершених, можна було дістатися пандусом, що збігається з едікулом, присвяченим місцю, де вперше була встановлена дерев'яна статуя Мадонни. Поруч з цим пандусом була розкопана невелика скельна церква, присвячена Святому Леонарду, яка разом з іншими невеликими печерами, виритими місцевими моряками, стала складами, де вони зберігали рибальські снасті. Усередині церкви Пульєзе знайшов середньовічні гробниці: одну в центрі церкви, яку приписують Мілетському магістру; іншу, надгробок якої зберігся, з рельєфно вирізьбленою фігурою Ecce homo і двома жіночими фігурами; від третьої, візантійської, залишилися лише фрагменти.Різноманітні перебудови, яких зазнала церква протягом століть, докорінно змінили її, і майже важко розгледіти дві її душі всередині: "нетипова ранньосередньовічна споруда візантійського зразка з центральним планом і тринавовою західною базилікою, з полярами і бочкоподібним склепінням, вираз не майстрів архітектури, а зі смаком витвір простих місцевих ремісників" (Ф. Пульєзе).Останні зміни відбулися нещодавно і пов'язані з землетрусом 1783 року, будівництвом сходів до 1810 року та землетрусом 1905 року. Навіть від давньої дерев'яної статуї Мадонни сьогодні залишився лише спогад: ми не знаємо середньовічного зображення "S. Maria ad Praesepe". Статуя Мадонни вісімнадцятого століття, яка є частиною групи Святого Сімейства, що зберігається в церкві, також була перероблена в 1950-х роках.