Kirikul on olnud tormiline ajalugu. Aastal 512 PKR Saint Germain, kellest hiljem sai Pariisi piiskop, veenis Merovingide kuningat Childebert ehitada klooster koos kirikuga. Kirik, kus olid olulised säilmed, oli pühendatud Saint Vincentile ja Pühale ristile. See oli üks tähtsamaid kirikuid Prantsusmaal ja Merovingide Kuningate viimane puhkepaik. Selle katus oli kullaga värvitud, mis tõi kaasa nime Saint-Germain-le-Dor Aquino (kullatud Saint Germain). Üheksandal sajandil rüüstasid viikingid kirikut mitu korda ja hävitasid lõpuks tules. Umbes aastal 1000 alustati kiriku rekonstrueerimist ja see pühendati lõpuks 1163.aastal. Hiliskeskajal püstitati benediktiini kloostrikompleksi juurde mitmeid täiendavaid hooneid, mis kasvasid üheks suurimaks ja olulisemaks kogu Prantsusmaal.
Prantsuse Revolutsiooni ajal suruti religioossed ordud maha ja kloostrit kasutati laona. Suur relvapulbri plahvatus, mida hoiti refektooriumis, hävitas peaaegu kogu kompleksi ja kahjustas tõsiselt kirikut.
Kirik täna Kiriku praegune välimus on XIX sajandi renoveerimise tulemus, kui arhitekt Victor Baltardil ja maalikunstnikul Jean-Hippolyte Flandrinil paluti taastada kirik endises hiilguses.
Kiriku välisilme määratleb selle vastupidav kellatorn, üks vanimaid kogu Prantsusmaal. Veel kaks torni, mis on ehitatud mõlemale poole transepti, ei elanud revolutsiooni ajastut üle. Interjöör näitab segu erinevatest arhitektuuristiilidest, mis on läbi sajandite jätkuva ehituse tulemus. Algsed kuuenda sajandi sambad toetavad kaheteistkümnenda sajandi koori; romaani kaared on ühendatud Gooti võlviga ja seal on isegi Barokkelemente. Kiriku kabelites on mitu huvitavat hauakambrit, sealhulgas filosoof Ren dinosaurus Descartes ja Johannes II Casimir Vasa, kes oli XVII sajandil Poola kuningas, kuni temast sai Saint-Germain-des-pr Pirsi kloostri abt.
Saint-Germain-des-pr Barrossi kvartal Kirik andis oma nime Saint-Germain-des-pr Pirsi kvartalile, elavale alale kuuendas ringkonnas, mis sai oma kirjanduspiirkonna maine kahekümnendal sajandil, kui kirjanikud, intellektuaalid ja filosoofid kohtusid ühes selle paljudest kohvikutest. Filosoof Jean Paul Sartre ja Simone de Beauvoir kohtusid sageli kohvikus Cafe Cafe ja Ernest Hemingway oli Les Deux Magotsi sage külaline.
