U rimsko doba, otok Patmos bio je mjesto progonstva, a učenik Isusa, Sveti Ivan u 95. godini, završio je na otoku jer je osuđen na progonstvo dvije godine. Zapravo, Patmos se jasno spominje u radu kao mjestu gdje je imao svoje vizije i napisao apokalipsu, posljednju od 27 knjiga Novog zavjeta. St. Anne ' s Cave, u kojoj se to trebalo dogoditi, smatra se jednim od najvažnijih mjesta u kršćanstvu. I zbog toga se Patmos naziva "Jeruzalem Mediterana". Samostan je osnovao Sveti Krist tijekom arapskog razdoblja, u XI stoljeću, a zatim je dobio ime po sv. Patmos je bio gotovo napušten kada je ovaj nadareni i obrazovani redovnik, St. Cristodulo u 1088 pitao i dobio u upravljanju cijeli otok od bizantskog cara Alexia i Comnina, jer je osnovao samostan u čast Svetog Ivana Teologa. San Cristodul je ostao u Patmosu do 1108. godine, kada je bio prisiljen napustiti ga zbog invazije turskih gusara i umro iste godine u Eubeju. Međutim, njegov san nastavio je nadahnuti druge redovnike koji su nastavili svoj rad u kasnijim stoljećima i proširili samostan između petnaestog i sedamnaestog stoljeća. Temelj samostana Svetog Ivana Teologa započeo je kulturni i vjerski put koji je doveo Otok da bude orijentir za cijelo kršćanstvo. Od tog vremena započeo je nevjerojatan razvoj na otoku Patmos, ne samo kulturno, već i gospodarsko. Stoljećima, gotovo tisućljećima povijesti, samostan San Giovanni uvijek je ostao aktivan i zadržao vrlo vrijedne freske i drevne dokumente. Otok Patmos proglašen je svetim patrijarhatom, sinodskim činom i zakonom 1155/81 grčke države. Samostan, zajedno s gradom Chora i špiljom apokalipse, 1999.godine proglašen je UNESCO-ve Svjetske baštine zbog svoje visoke univerzalne vrijednosti. Samostan, vidljiv izvana, izgleda kao tvrđava sa svojim impresivnim zidovima od 15 metara. Zapravo, izgrađen je na najvišem vrhu Patmosa s idejom stvaranja mjesta dobro zaštićenog od gusara. Nakon smrti redovnika, završena je izgradnja moćnih vanjskih zidova glavne crkve (tzv. Unutar samostana ima mnogo dvorišta, samostana i 10 kapela. U središnjem dvorištu s tri velika luka izgrađena 1698. godine nalazi se katolička crkva koja se sastoji od glavne crkve, kapele Svetog Krista i kapele Djevice. Kapela posvećena Bogorodici ima pravokutni izgled i sadrži najstarije freske samostana koji datiraju iz kraja XI stoljeća. Unutar crkve, s grčkim križem i središnjom kupolom, nalazi se ikonostas iz 1820. i neke freske iz 17. stoljeća.