Začetki samostana Kostomarovski Spasski niso zanesljivo znani, vendar naj bi ga kot samostan v 17. stoletju ustanovili menihi iz Ukrajine, ki so se tu naselili skupaj s kozaki. Možno pa je, da je samostan v resnici veliko starejši, in obstaja celo teorija, da izvira iz časov, ko se je v Rusiji prvič pojavilo krščanstvo.
Prva pisna omemba samostana sega v konec 18. stoletja, ko je omenjen kot skelet belogorskega Voskresenskega samostana. Po revoluciji je bil samostan zaprt, čeprav je nekaj menihov na skrivaj ostalo v njem. Eden takih menihov je bil starešina Pjotr, ki so ga odkrili konec tridesetih let 20. stoletja in ga zaprli, kasneje pa naj bi v zaporu tudi umrl. Med drugo svetovno vojno je bil nekdanji samostan na okupiranem ozemlju in nekateri domačini naj bi se skrivali v jamah. Po vojni je bilo za kratek čas dovoljeno ponovno odpreti Odrešenikovo katedralo, vendar so jo leta 1959 pod Hruščovovo protireligiozno politiko ponovno zaprli. Leta 1997 je bilo ozemlje vrnjeno pravoslavni cerkvi in ponovno odprto, vendar kot samostan in ne kot samostan.
