Počátky kostela a Kostnice sahají až do třináctého století a jsou spojeny s historií Nemocnice Brolo, která již neexistuje. V roce 1642 byly obě budovy vážně poškozeny zřícením zvonice nedalekého kostela Santo Stefano. Kostnice byla rychle opravena a kostel byl přestavěn v roce 1750 v barokním a rokokovém stylu architekty Andrea Biffi a Carlo Giuseppe Merlo, z nichž druhý pracoval na projektu hlavní věže Duomo. Díky pravidelnému zarovnání oken na vnější straně je fasáda více připomínající majestátní palác z osmnáctého století než barokní kostel. Interiér kostela má osmiboký půdorys se dvěma bočními kaplemi a barokními mramorovými oltáři. Úzká chodba vpravo od vchodu umožňuje přístup do kaple Kostnice. Jedná se o malou čtvercovou místnost zdobenou oltářem a výklenkem se sochou Madony Addolorata (Panny Marie Bolestné) klečící před Ježíšovým tělem.
Stěny jsou téměř úplně pokryty lebkami a kostmi, uspořádanými ve výklencích a na římsách, sloupech a dveřích. Jsou považovány za ostatky zesnulého z nemocnice Brolo, z mrtvol odebraných ze zaniklých hřbitovů ze sedmnáctého století. Lebky uzavřené v pouzdrech nad dveřmi jsou lebky popravených vězňů.
Kostnice byla kdysi vyzdobena freskami Sebastiana Ricciho, předchůdce Tiepola, který představil benátskou barokní malbu v Miláně. Představovali "triumf duší v letu andělů" a slávu čtyř patronů: Santa Maria Vergine, s.Ambrogio, s. Sebastiano a s. Bernardino da Siena.
