Originile Bisericii și ale osuarului datează din secolul al XIII-lea și sunt legate de istoria Spitalului Brolo care acum nu mai există. În 1642 ambele edificii au fost grav avariate de prăbușirea clopotniței bisericii Santo Stefano din apropiere. Osuarul a fost reparat rapid, iar biserica a fost reconstruită în 1750 în stil baroc și Rococo de către arhitecții Andrea Biffi și Carlo Giuseppe Merlo, acesta din urmă lucrând la proiectul turlei principale a Domului. Datorită alinierii regulate a ferestrelor la exterior, fa-ul este mai mult o reminiscență a unui palat impunător din secolul al XVIII-lea decât a unei biserici baroce. Interiorul bisericii are un plan octogonal cu două capele laterale și altare de marmură barocă. Un coridor îngust din dreapta intrării oferă acces la osuarul capelei. Este o mică cameră pătrată împodobită cu un altar și o nișă cu statuia Madonei Addolorata (Maica Domnului durerilor) îngenuncheată în fața trupului lui Isus.
Pereții sunt aproape în întregime acoperiți cu cranii și oase, dispuse în nișe și pe cornișe, stâlpi și uși. Se crede că sunt rămășițele decedatului de la Spitalul Brolo, din cadavrele luate din cimitirele defuncte din secolul al XVII-lea. Craniile închise în cutii deasupra ușii sunt cele ale prizonierilor executați.
Capela osuarului a fost odată decorată cu fresce de Sebastiano Ricci, un precursor al Tiepolo care a introdus pictura barocă venețiană în Milano. Ei au reprezentat un "triumf al sufletelor într-un zbor de îngeri" și gloria celor patru sfinți patroni: Santa Maria Vergine, S. Ambrogio, S. Sebastiano și S. Bernardino da Siena.
