Ez a nem túl turistás bazilika San Clemente al Laterano Róma történetét meséli el a templom különböző rétegei alapján. A jelenlegi "San Clemente" templomot, amelyet I. Kelemen pápának szenteltek, egy 4. századi templom tetejére építették a 12. században. Alatta még számos római kori alapot találtak. A jelenlegi bazilika egy a sok közül Rómában, és nem a látogatás fő oka, de 20 méterrel a templom alatt római kori házak maradványait (Kr. e. 500-27) találták meg. Úgy gondolják, hogy a házakat egy nagy tűzvész pusztította el Néró császár uralkodása alatt, és később alapozásra használták őket.
Ezen alapok tetején egy másik nagy házat találtak, amely az 1. században épült. Ez a ház Kelemen pápa titkos templomaként szolgált abban az időben, mivel akkoriban még nem volt vallásszabadság.
A 4. században, amikor a vallásszabadságot megadták, a titkos templom tetejére bazilikát építettek. A templomot Szent Kelemen, Péter harmadik pápai utódjának sírjának szentelték. Ezt a bazilikát az teszi egyedülállóvá, hogy festők és szobrászok milyen gazdagon díszítették.
1084-ben a templom nagy része elpusztult a vikingek támadásai során, ami után Pásztor pápa a 12. században új templomot építtetett a régi fölé. Az erős alapozás érdekében a régi templom egyes részeit befalazták és feltöltötték.
1862 óta számos ásatást végeztek, hogy feltárják az altemplom ősi szerkezeteit, mozaikjait és freskóit. Ha meglátogatja a templomot, a templom történetének különböző rétegeiben utazik.