Crkva i samostan San Damiano nalaze se nedaleko od centra Assisija. Kompleks je prvobitno bio benediktinski Priorat, čiji zapisi datiraju iz 1030.godine. Do crkve dolazite kroz kapelu: desno ćete pronaći Madonu i dijete, sa Ss-om. Francis, Clare, Bernardino i Jerome, freska lokalnog slikara iz sredine četrnaestog stoljeća. Crkva ima jednu navu, sa ogival barel trezori i duboki hor. Odmah desno od ulaza nalazi se prozor s kojeg je sveti Franjo bacio novac koji je sveštenik San Damiano odbio za obnovu crkve. Duž zidova možete vidjeti ostatke gipsane konstrukcije, obrubljene polihromnim okvirima, pripremljene za freske koje nikada nisu napravljene. U kapeli koja je dodata u 1535-u je drveni Raspelo (izraz na Hristovom licu se menja u zavisnosti od tačke gledišta), urezano od strane Fra Innocenzo da Palermo u 1637-u. Na glavnom oltaru nalazi se kopija raspeća koje je razgovaralo sa Svetim Francisom (original se čuva u bazilici Santa Chiara). Drveni hor iz 1504. djelomično pokriva mali prozor kroz koji su siromašni Clares komunicirali i ispred kojih je tijelo Svetog Franje prevezeno iz Porziuncole u Assisi. Ulazeći u Vestibul s desne strane, pod kojim su sahranjena četiri saputnika Saint Clare, dolazite do sakristije. S lijeve strane je jednostavan zbor u kojem ćete pronaći i predavač Saint Clare. Pred oltarom je raspeće, freska Piera Antonija Mezzastrisa iz 1482.godine. Sa lijeve strane možete vidjeti malu komoru u kojoj, tradicija država, Francis je utočište od svog oca. Vraćajući se u Vestibul, penjete se nekoliko koraka, ostavljajući desno kroz Giardinetto di Santa Chiara (vrt Saint Clare), malu terasu s pogledom na ravnicu ispod. Umjesto toga, spuštajući se u samostan, možete se diviti na dva ugaona zida, freskama Eusebio da San Giorgio (1507), Svetog Francisa koji prima stigmate i Blagovijest. Zatim dolazite do pravougaone trpezarije, sa niskim plafonima, slične kripti, sa originalnim klupama i stolovima: krst i vaza cvijeća označavaju mjesto koje je nekada zauzimao Saint Clare.